La Secretaría Técnica del Órgano de Reglamentación Técnica fue establecida de conformidad con el artículo 42 de la Ley del Sistema Nacional de la Calidad N°8279, publicada en La Gaceta N° 96 del 21 de mayo del 2002.

Esta Secretaría Técnica es a su vez la secretaría del Comité Nacional del Codex Alimentarius y el punto de contacto del Comité Internacional del Codex Alimentarius.

Sus principales funciones son:

• Convocar al ORT.
• Dar el apoyo administrativo necesario para la gestión del Órgano.
• Otorgar la audiencia ordenada en el artículo 39 de la presente Ley.
• Asesorar y capacitar a los entes del Estado con facultades para proponer la emisión de reglamentos técnicos, en cuanto a la conformación de los comités técnicos para elaborar, adoptar y aplicar tales reglamentos.
• Mantener canales de información regionales e internacionales en el ámbito reglamentario.
• Establecer los mecanismos de coordinación con instituciones similares en el ámbito nacional e internacional, para facilitar las actividades de integración y armonización de los reglamentos técnicos y las definiciones internacionales.
• Organizar y administrar el Centro de Información en Obstáculos Técnicos al Comercio.
• Otras que le correspondan por ley o reglamento